Das EPD wird in der Schweiz nicht zentral, sondern dezentral mit verschiedenen EPD-Anbietern umgesetzt. Es ist ein Zusammenschluss von regionalen Umsetzungen. Die rechtlichen Vorgaben und Regeln sind aber schweizweit die gleichen. Es gibt mehrere Gründe, warum das EPD nicht zentral organisiert ist. Erstens kann ein nationales Grosskonzept die regionalen Besonderheiten des föderalen Gesundheitssystems in der Schweiz nicht berücksichtigen. Verantwortlich für die Gesundheitsversorgung sind die Kantone. Das EPD muss deshalb in den Versorgungsregionen verankert sein und dort von der Bevölkerung und den Gesundheitsfachpersonen genutzt werden. Zweitens hat der dezentrale Ansatz Vorteile für die Datensicherheit. Die Daten im EPD sind verschlüsselt gespeichert. Es gibt nicht nur einen zentralen Ort, an dem alle EPD-Dokumente gespeichert sind. Alle Datenspeicher müssen sich aber in der Schweiz befinden und unterstehen dem Schweizer Recht.